ভারত মহাসাগরের একটি উল্লেখযোগ্য সাগর হলো লোহিত সাগর (Red Sea) । Trichodesmium erythraeum নামক এক ধরনের সায়ানোব্যাকটেরিয়ার উপস্থিতি থাকায় লোহিত সাগরের পানি লালচে-বাদামী রং ধারণ করে। এজন্য এ সাগরের নাম রাখা হয়েছে লোহিত সাগর। এ সাগর এশিয়া মহাদেশকে আফ্রিকা মহাদেশ থেকে পৃথক করে। এ সাগরের দৈর্ঘ্য প্রায় ২,২৫০ কিলোমিটার। এটি সর্বাধিক প্রশস্ত হয়েছে ইরিত্রিয়ার মাসাকাওয়া এলাকায় (৩০৬-৩৫৫ কিলোমিটার) । লোহিত সাগরের সর্বনিম্ন প্রস্থ দেখা ‍যায় বাব এল মান্দেব প্রণালীতে। সেখানে লোহিত সাগরের প্রস্থ মাত্র ২৬-২৯ কিলোমিটার। এ প্রণালী লোহিত সাগরকে এডেন উপসাগরের সাথে সংযুক্ত করে। এডেন উপসাগর ভারত মহাসাগরের একটি উগসাগর। লোহিত সাগরের গড় গভীরতা প্রায় ৪৯০ মিটার। লোহিত সাগরের উত্তর-পশ্চিমে আছে ভূমধ্যসাগর। কৃত্রিম সুয়েজ খাল ভূমধ্যসাগরকে লোহিত সাগরের সাথে সংযুক্ত করে। এ সুয়েজ খালের মাধ্যমেই ভূমধ্যসাগর থেকে লোহিত সাগর হয়ে ভারত মহাসাগরে জাহাজ চলাচল করে। এশিয়া মহাদেশের সৌদি আরব, ইয়েমেন এবং আফ্রিকা মহাদেশের মিশর, সুদান, ইরিত্রিয়া ও জিবুতি লোহিত সাগরের উপকূলীয় রাষ্ট্র।